Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Amigo1Q80ZD8 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
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Amigo1Q80ZD8 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
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Amigo1Q80ZD8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Amigo1Q80ZD8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
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Amigo1Q80ZD8 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Amigo1Q80ZD8 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Amigo1Q80ZD8 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Amigo1Q80ZD8 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Amigo1Q80ZD8 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Amigo1Q80ZD8 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Amigo1Q80ZD8 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Amigo1Q80ZD8 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms