Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms