Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC1

Prrc2a, Protein PRRC2A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2aQ7TSC1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrc2aQ7TSC1 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms