Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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