Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Nme8Q715T0 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Nme8Q715T0 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nme8Q715T0 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Nme8Q715T0 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Nme8Q715T0 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Nme8Q715T0 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Nme8Q715T0 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Nme8Q715T0 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nme8Q715T0 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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