Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BC061212Q6P8K3 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms