Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
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NipblQ6KCD5 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
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NipblQ6KCD5 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
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NipblQ6KCD5 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
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NipblQ6KCD5 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
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