Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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Pdzrn3Q69ZS0 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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Pdzrn3Q69ZS0 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Pdzrn3Q69ZS0 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Pdzrn3Q69ZS0 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Pdzrn3Q69ZS0 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Pdzrn3Q69ZS0 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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