Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Col4a5Q63ZW6 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms