Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Taf6Q62311 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms