Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Ss18Q62280 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Ss18Q62280 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Ss18Q62280 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Ss18Q62280 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Ss18Q62280 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Ss18Q62280 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Ss18Q62280 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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