Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms