Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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AtrxQ61687 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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AtrxQ61687 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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AtrxQ61687 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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AtrxQ61687 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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AtrxQ61687 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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AtrxQ61687 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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AtrxQ61687 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms