Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms