Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
JrkQ60976 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
JrkQ60976 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
JrkQ60976 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
JrkQ60976 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
JrkQ60976 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
JrkQ60976 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms