Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc6a4Q60857 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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