Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Traf3Q60803 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Traf3Q60803 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Traf3Q60803 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Traf3Q60803 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Traf3Q60803 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Traf3Q60803 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Traf3Q60803 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Traf3Q60803 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Traf3Q60803 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Traf3Q60803 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms