Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp20Q5XG71 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms