Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsf15Q5UBV8 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms