Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Olfr282-203ENSMUST00000213608 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tsr1Q5SWD9 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms