Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

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Length 1,511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Znf608Q56A10 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Znf608Q56A10 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Znf608Q56A10 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Znf608Q56A10 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Znf608Q56A10 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Znf608Q56A10 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Znf608Q56A10 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Znf608Q56A10 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Znf608Q56A10 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Znf608Q56A10 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Znf608Q56A10 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf608Q56A10 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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