Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms