Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Usp48Q3V0C5 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Usp48Q3V0C5 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Usp48Q3V0C5 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Usp48Q3V0C5 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms