Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ttc9Q3V038 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ttc9Q3V038 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ttc9Q3V038 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ttc9Q3V038 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ttc9Q3V038 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms