Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm6899Q3USS0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm6899Q3USS0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6899Q3USS0 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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