Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm28047Q3US59 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm28047Q3US59 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm28047Q3US59 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm28047Q3US59 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm28047Q3US59 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm28047Q3US59 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm28047Q3US59 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm28047Q3US59 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm28047Q3US59 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm28047Q3US59 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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