Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Znf48Q3US17 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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Znf48Q3US17 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Znf48Q3US17 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Znf48Q3US17 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Znf48Q3US17 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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Znf48Q3US17 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Znf48Q3US17 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Znf48Q3US17 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Znf48Q3US17 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Znf48Q3US17 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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