Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec31aQ3UPL0 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms