Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN58

Faap20, Fanconi anemia core complex-associated protein 20, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faap20Q3UN58 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Faap20Q3UN58 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Faap20Q3UN58 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Faap20Q3UN58 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Faap20Q3UN58 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Faap20Q3UN58 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Faap20Q3UN58 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Faap20Q3UN58 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Faap20Q3UN58 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Faap20Q3UN58 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Faap20Q3UN58 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Faap20Q3UN58 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Faap20Q3UN58 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms