Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms