Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Gtpbp6Q3U6U5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16234-201ENSMUST00000124976 815 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11266-201ENSMUST00000139835 1271 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r228-201ENSMUST00000072410 1443 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Gtpbp6Q3U6U5 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Gtpbp6Q3U6U5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7647-201ENSMUST00000200996 1389 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms