Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q3U6N9 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q3U6N9 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Q3U6N9 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Q3U6N9 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q3U6N9 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q3U6N9 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q3U6N9 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Q3U6N9 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Q3U6N9 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q3U6N9 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q3U6N9 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q3U6N9 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Q3U6N9 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Q3U6N9 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q3U6N9 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q3U6N9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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