Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms