Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms