Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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Ctdnep1Q3TP92 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdnep1Q3TP92 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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