Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms