Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Cd8a-202ENSMUST00000172321 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccbe1Q3MI99 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms