Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms