Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tff1Q08423 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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