Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdx4Q07424 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms