Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cab39Q06138 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms