Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdk18Q04899 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms