Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl7Q03366 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms