Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
RykQ01887 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RykQ01887 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RykQ01887 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RykQ01887 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RykQ01887 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RykQ01887 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RykQ01887 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
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RykQ01887 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RykQ01887 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RykQ01887 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RykQ01887 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RykQ01887 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RykQ01887 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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RykQ01887 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
RykQ01887 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RykQ01887 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RykQ01887 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RykQ01887 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RykQ01887 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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RykQ01887 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RykQ01887 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RykQ01887 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RykQ01887 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RykQ01887 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RykQ01887 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RykQ01887 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RykQ01887 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RykQ01887 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RykQ01887 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RykQ01887 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RykQ01887 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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RykQ01887 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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RykQ01887 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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RykQ01887 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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RykQ01887 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RykQ01887 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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RykQ01887 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RykQ01887 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RykQ01887 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RykQ01887 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RykQ01887 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RykQ01887 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RykQ01887 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RykQ01887 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RykQ01887 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
RykQ01887 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
RykQ01887 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RykQ01887 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RykQ01887 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RykQ01887 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
RykQ01887 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RykQ01887 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RykQ01887 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
RykQ01887 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms