Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd1Q01822 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms