Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Vbp1P61759 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Vbp1P61759 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Vbp1P61759 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Vbp1P61759 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Vbp1P61759 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Vbp1P61759 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Vbp1P61759 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Vbp1P61759 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Vbp1P61759 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Vbp1P61759 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Vbp1P61759 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Vbp1P61759 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Vbp1P61759 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Vbp1P61759 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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