Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CgnP59242 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CgnP59242 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CgnP59242 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CgnP59242 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CgnP59242 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CgnP59242 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CgnP59242 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CgnP59242 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CgnP59242 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CgnP59242 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CgnP59242 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CgnP59242 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CgnP59242 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CgnP59242 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CgnP59242 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CgnP59242 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CgnP59242 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CgnP59242 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CgnP59242 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CgnP59242 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CgnP59242 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CgnP59242 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CgnP59242 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CgnP59242 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CgnP59242 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CgnP59242 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CgnP59242 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CgnP59242 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CgnP59242 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CgnP59242 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CgnP59242 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CgnP59242 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CgnP59242 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CgnP59242 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CgnP59242 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CgnP59242 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CgnP59242 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CgnP59242 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CgnP59242 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CgnP59242 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CgnP59242 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CgnP59242 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CgnP59242 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CgnP59242 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CgnP59242 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CgnP59242 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CgnP59242 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CgnP59242 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CgnP59242 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CgnP59242 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CgnP59242 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CgnP59242 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CgnP59242 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CgnP59242 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CgnP59242 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CgnP59242 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CgnP59242 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CgnP59242 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CgnP59242 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CgnP59242 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CgnP59242 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CgnP59242 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CgnP59242 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CgnP59242 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CgnP59242 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CgnP59242 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CgnP59242 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CgnP59242 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CgnP59242 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CgnP59242 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CgnP59242 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CgnP59242 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CgnP59242 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CgnP59242 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CgnP59242 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CgnP59242 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CgnP59242 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CgnP59242 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CgnP59242 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CgnP59242 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CgnP59242 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CgnP59242 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CgnP59242 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CgnP59242 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CgnP59242 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CgnP59242 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CgnP59242 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CgnP59242 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CgnP59242 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CgnP59242 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CgnP59242 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CgnP59242 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CgnP59242 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CgnP59242 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CgnP59242 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CgnP59242 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CgnP59242 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CgnP59242 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CgnP59242 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms