Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P58686 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P58686 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P58686 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P58686 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P58686 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P58686 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P58686 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P58686 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P58686 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P58686 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P58686 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P58686 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P58686 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P58686 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P58686 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P58686 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P58686 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P58686 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P58686 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P58686 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P58686 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P58686 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P58686 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P58686 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P58686 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P58686 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P58686 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P58686 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P58686 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P58686 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P58686 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P58686 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P58686 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P58686 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P58686 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P58686 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P58686 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P58686 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P58686 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P58686 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P58686 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P58686 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P58686 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P58686 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P58686 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P58686 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P58686 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms