Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CitP49025 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CitP49025 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CitP49025 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CitP49025 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CitP49025 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CitP49025 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CitP49025 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CitP49025 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CitP49025 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CitP49025 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CitP49025 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CitP49025 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CitP49025 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CitP49025 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CitP49025 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CitP49025 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CitP49025 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CitP49025 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CitP49025 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CitP49025 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CitP49025 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CitP49025 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CitP49025 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CitP49025 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CitP49025 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CitP49025 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CitP49025 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CitP49025 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CitP49025 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CitP49025 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CitP49025 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CitP49025 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CitP49025 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CitP49025 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CitP49025 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CitP49025 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CitP49025 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CitP49025 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CitP49025 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CitP49025 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CitP49025 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CitP49025 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CitP49025 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CitP49025 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CitP49025 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CitP49025 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CitP49025 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CitP49025 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CitP49025 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CitP49025 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CitP49025 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CitP49025 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CitP49025 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CitP49025 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CitP49025 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CitP49025 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CitP49025 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CitP49025 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CitP49025 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CitP49025 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CitP49025 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CitP49025 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CitP49025 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CitP49025 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CitP49025 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CitP49025 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CitP49025 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CitP49025 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CitP49025 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CitP49025 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CitP49025 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CitP49025 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CitP49025 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CitP49025 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CitP49025 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CitP49025 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CitP49025 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CitP49025 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CitP49025 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CitP49025 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CitP49025 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CitP49025 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CitP49025 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CitP49025 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CitP49025 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CitP49025 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CitP49025 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CitP49025 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CitP49025 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CitP49025 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CitP49025 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CitP49025 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CitP49025 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CitP49025 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CitP49025 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CitP49025 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CitP49025 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CitP49025 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CitP49025 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms