Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrprbP47758 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrprbP47758 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrprbP47758 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrprbP47758 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SrprbP47758 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrprbP47758 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrprbP47758 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms